Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms