Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNIP4Q6PIL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms