Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTR9Q6PD62 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms