Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A1Q6PCB7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms