Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN1Q6NZI2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms