Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEPROQ6NW34 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEPROQ6NW34 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms