Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SWSAP1Q6NVH7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SWSAP1Q6NVH7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms