Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms