Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF3Q5VWG9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF3Q5VWG9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.8 ms