Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOCADQ5VW36 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOCADQ5VW36 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms