Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF17Q5VTA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF17Q5VTA0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF17Q5VTA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF17Q5VTA0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF17Q5VTA0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF17Q5VTA0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF17Q5VTA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms