Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms