Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PXDC1Q5TGL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PXDC1Q5TGL8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms