Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYT6Q5T7P8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYT6Q5T7P8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms