Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P5Q59GN2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms