Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCBP3Q53F19 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP3Q53F19 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms