Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VWA3BQ502W6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms