Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC153Q494R4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms