Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FHOD3Q2V2M9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHOD3Q2V2M9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHOD3Q2V2M9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms