Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIDA1Q1XH10 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIDA1Q1XH10 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms