Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FSCN1Q16658 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN1Q16658 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms