Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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TAF9Q16594 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TAF9Q16594 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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