Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP3Q15836 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms