Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCOA1Q15788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
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