Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SF1Q15637 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SF1Q15637 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF1Q15637 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF1Q15637 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF1Q15637 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SF1Q15637 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF1Q15637 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF1Q15637 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SF1Q15637 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SF1Q15637 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SF1Q15637 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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