Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1AQ15573 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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