Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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