Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCAPD2Q15021 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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