Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SSPNQ14714 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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