Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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