Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PDE6HQ13956 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6HQ13956 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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