Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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