Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SHROOM2Q13796 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
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