Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1SQ13698 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA1SQ13698 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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