Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FHL3Q13643 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FHL3Q13643 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms