Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL3Q13618 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CUL3Q13618 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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