Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR1Q13613 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTMR1Q13613 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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