Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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DNASE1L3Q13609 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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DNASE1L3Q13609 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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DNASE1L3Q13609 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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DNASE1L3Q13609 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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DNASE1L3Q13609 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNASE1L3Q13609 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNASE1L3Q13609 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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