Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF5Q13568 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF5Q13568 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms