Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF1Q13077 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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