Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TWF1Q12792 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWF1Q12792 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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