Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YBL094CYBL094C 333 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MVD1YNR043W 1191 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PNT1YOR266W 1272 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 CAF20YOR276W 486 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YBR053CYBR053C 1077 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MRPL37YBR268W 318 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 JEN1YKL217W 1851 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YAT2YER024W 2772 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 GCD6YDR211W 2139 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MSM1YGR171C 1728 nt3.02□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 LTV1YKL143W 1392 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 TRM12YML005W 1389 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YOR365CYOR365C 2112 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 IRC6YFR043C 714 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MRPS35YGR165W 1038 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 QCR10YHR001W-A 234 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 REX3YLR107W 1215 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MRPS17YMR188C 714 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YMR310CYMR310C 954 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 HHF1YBR009C 312 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 DNM1YLL001W 2274 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 ESL1YIL151C 3357 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 XRN1YGL173C 4587 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 HRD1YOL013C 1656 nt3.01□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 NDC80YIL144W 2076 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 BUD4YJR092W 4344 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YDR355CYDR355C 303 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 SPT2YER161C 1002 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 CGR1YGL029W 363 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PNC1YGL037C 651 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 RPL1BYGL135W 654 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 COX18YGR062C 951 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 ERG2YMR202W 669 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 INN1YNL152W 1230 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 RPL1AYPL220W 654 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MSS4YDR208W 2340 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 FUN30YAL019W 3396 nt3□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 FLO1YAR050W 4614 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PXR1YGR280C 816 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YAR069CYAR069C 294 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 RIB4YOL143C 510 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YOR263CYOR263C 408 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PLP2YOR281C 861 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YPL107WYPL107W 747 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 DIM1YPL266W 957 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 VBA4YDR119W 2307 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 TSC11YER093C 4293 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PBI1YPL272C 1554 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 DSS1YMR287C 2910 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 CBP2YHL038C 1893 nt2.99□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YDL199CYDL199C 2064 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MSW1YDR268W 1140 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 APA2YDR530C 978 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 SCL1YGL011C 759 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 IME1YJR094C 1083 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 SKG1YKR100C 1068 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YAL069WYAL069W 315 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 DDI3YNL335W 678 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MRPL51YPR100W 423 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 ERG11YHR007C 1593 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MET10YFR030W 3108 nt2.98□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PAF1YBR279W 1338 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 NDT80YHR124W 1884 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MCM21YDR318W 1107 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 SDP1YIL113W 630 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 RPC37YKR025W 849 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YBL010CYBL010C 843 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 CDC20YGL116W 1833 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 YHR080CYHR080C 4038 nt2.97□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 MDV1YJL112W 2145 nt2.96□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 COM2YER130C 1332 nt2.96□□□□□ -1.93
MSH5Q12175 PHO81YGR233C 3537 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 CEP3YMR168C 1827 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 PCL2YDL127W 927 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 RMT2YDR465C 1239 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 DAL2YIR029W 1032 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 YLR444CYLR444C 303 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 SSU72YNL222W 621 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 HNT3YOR258W 654 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 SUR1YPL057C 1149 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 PPT2YPL148C 522 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 MET16YPR167C 786 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 YPS6YIR039C 1614 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 STT4YLR305C 5703 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 RIF1YBR275C 5751 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 SRB8YCR081W 4284 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 ITC1YGL133W 3795 nt2.96□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 YTA7YGR270W 4140 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 CHO2YGR157W 2610 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 ENT5YDR153C 1236 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 NSE3YDR288W 912 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 DUO1YGL061C 744 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 RPC17YJL011C 486 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 RSM26YJR101W 801 nt2.95□□□□□ -1.94
MSH5Q12175 YAR075WYAR075W 474 nt2.95□□□□□ -1.94
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