Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPSF1Q10570 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPSF1Q10570 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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