Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC173Q0VFZ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms