Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF543Q08ER8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms