Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf54Q08AI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms