Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN5Q08AF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFN5Q08AF3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms