Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARID5AQ03989 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID5AQ03989 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms