Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms