Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms